雪湖科技携手阿里云重磅发布分子动力学云上FPGA加速方案

 
 
 

12月21日,澎湃算力,无处不在——2021阿里云弹性计算年度峰会在线上隆重开启。在此次峰会上,雪湖科技携手阿里云重磅发布基于阿里云 FaaS(FPGA as a Service)的MD分子动力学FPGA加速方案。此次发布的产品为雪湖科技生命科学超算的产品的一部分,高性能的分子动力学模拟算力服务将为新药发现和生命科学研究创新提供更多的可能。

近年来,生命科学研究和药物发现领域加速进入到了新的范式时代,基于物理计算(第一性原理)和人工智能的新方法被越来越多的被应用到科学研究和新药研发当中。但受制于计算机算力的限制,对于大规模体系蛋白质的模拟依然需要耗费数周甚至数月的时间。此次雪湖科技与阿里云推出的MD分子动力学FPGA加速方案,能够为药物发现和生命科学行业提供远高于同行业的加速性能,助力科研机构和新药研发企业的创新。

 

【MD分子动力学FPGA加速方案发布】


 

此次发布基于阿里云 FaaS 的云上分子动力学模拟具备如下特性:

 

为f3量身打造的FPGA分子动力学引擎

 

最大支持百万原子体系每天0.1 微秒级的高性能模拟仿真

 

与主流分子动力学模拟软件兼容

 

支持 AMBER 分子力场、Verlet 积分、Nose-Hoover 温度耦合方法

 

使用SETTLE/RATTEL 约束算法

 

阿里云弹性计算年度峰会分享了在前沿技术、产品生态、上云实践等方面最新的业态解读与创新实践。雪湖科技作为一家专注于高性能计算芯片设计和算力解决方案研发的创新企业,公司主要面向生命科学计算、油气勘探,分布式存储和智能网联汽车等领域提供大算力专用计算设备和解决方案,而此次与阿里云的携手也将针对当前市场上新药研发的痛点问题,助力生物医药的发展。