雪湖科技基于自研可重构专用计算机技术和分子动力学模拟专用引擎“Yaddle-MD”打造的分子动力学模拟专用计算机，能够大幅度提升分子动力学模拟的尺度体系和时长，性能接近于著名生命科学专用计算机 ANTON，填补了在这一领域里面没有商用级专用计算机的空白。为生命科学研究，新药研发等提供强有力的算力技术社会支撑。
项目概述
近年来，传统的基于结构 (structure-based) 的设计方法已经逐渐达到其极限，使得用于药物研究和发现的资本开支呈指数级增长。因而，对于药物设计领域来说，基于运动 (motion-based) 的药物设计方案，即分子动力学模拟，业界相当激动人心和创新性的进步。而分子动力学模拟的实现，则对算力有极高的要求。
在过去，分子动力学计算需要大型专用计算机提供的算力支撑。但是致力于提供“专用计算机”解决方案的雪湖科技，希望打破这个瓶颈，开发出一种比传统专用计算机性能更高而且成本更低、能效更高的解决方案。
行业挑战
产品类型
算力服务
专用计算集群
从性能上看，雪湖科技 Yaddle MD FPGA 分子动力学专用引擎运行在 Alveo 加速器卡上，比仅用 CPU 的分子动力学软件方案高近 50 倍，比使用 GPU 加速的分子动力学软件方案高两倍，如图 2 所示。与此同时，FPGA 的功耗仅为 CPU 的 2/3，GPU 的 2/9，为此使得 Yaddle MD 每度电可以提供的模拟量是 CPU 的近 100 倍，GPU 的近 10 倍。
雪湖科技生命科学计算首席科学家盛楠博士表示：“就像破案时‘看监控录像’远比‘看现场照片’要容易捕捉作案细节一样，分子动力学模拟让药物设计人员更直接的‘看到’药物分子的整个生效过程，从而大幅提高新药研发的成功率。高性能是确保分子动力学计算高效和精准的关键，雪湖科技基于 Alveo 的高性能分子动力学专用引擎，不仅能为客户节省大量时间成本，而且为基于动力学的药物设计提供了一种可能性”。
目前，雪湖科技的 Yaddle MD 引擎已经开始通过阿里云提供 MD 加速服务，其基于 Alveo 卡的加速方案也正在小规模对外开发测试中。与此同时，雪湖科科技的创新步伐还在继续，其计划未来将通过多个 Alveo 设备结合的形式继续扩展仿真能力，进一步为分子动力学计算应用提速并扩大吞吐量。
数据来源于雪湖科技内部测试
雪湖科技 Yaddle MD FPGA 分子动力学专用引擎与竞争解决方案相比，性能更高且能耗更低
产品性能
* 生命科学专用计算机概念产品
