雪湖科技高性能专用计算设备首次亮相2024年国际定量生物学大会

近日,第18届Q-Bio国际会议于2024年7月26日至29日在深圳召开,大会以复杂生命系统的定量规律与可预测模型为主题,涵盖人工智能、合成生物学、系统生物学、肿瘤生物学、分子进化、微生物组等领域的前沿研究,通过特邀主题演讲、口头报告和海报展示的形式,分享及研讨定量生物学领域的最新成果。

会议由中国科学院深圳先进技术研究院、深圳理工大学(筹)、深圳合成生物学创新研究院、北京大学、深圳市合成生物学协会等多方联合主办,旨在为广大从事定量生物学等相关领域的青年学者提供了交流平台,就生命系统多尺度下的复杂行为和定量规律等重要问题进行探讨、交流,共同促进数学、物理学、计算机科学和生命科学的融合发展。

 

 

 

 

雪湖科技携分子动力学模拟高性能专用超算亮相Q-Bio 2024国际定量生物学大会,展现雪湖科技高性能定制化计算平台及超算技术革新,为生物计算研究提供强大的算力支撑。

分子动力学模拟高性能专用计算设备的首次公开亮相,吸引了众多参会者的围观,通过面对面的沟通,分享我们的研究心得和经验,听取同行的宝贵意见和建议,共同推动定量生物学领域的发展。

 

雪湖科技专用计算设备亮相Q-Bio大会

 

1、自主芯片研发搭载3D高速网络通信

雪湖科技分子动力学模拟高性能专用计算设备使用512颗亿门级FPGA芯片组成,芯片片内最高可达32GB HBM2高带宽内存,内存访问高达460GB/s,芯片之间使用全双工200Gbps高速光纤直接连接,每颗芯片具有6维通信信道,整个集群采用3D-Torus网络拓扑。通讯协议使用自研MetaBandTM低时延高速通讯协议,通讯时延在百纳秒量级,与目前超算使用的美国InfiniBand网络通讯技术相当,达到国际领先水平。通过芯片上运行专用计算引擎,实现超高速的科学计算。

 

2、为超大生物体系分子动力学模拟赋能

目前传统的分子动力学模拟往往被限制在100万原子以下的小体系及小于10微秒的时间尺度,远不足以刻画许多真实的系统。

分子动力学模拟专用计算设备计算能力之强大,足以高效处理包含高达100000000个原子的复杂系统,这一性能飞跃不仅超越了行业标杆——英伟达Selene超级计算机,更是实现了十倍以上的性能提升。尤为值得一提的是,雪湖科技的超算解决方案采用了独特的创新路径,依托成熟的芯片工艺技术,自主研发了专用计算芯片。这一创新不仅打破了传统工艺芯片的性能瓶颈,更通过定制化设计满足了生物制药、新能源电池研发、核聚变、航空航天等关键领域对高性能计算的迫切需求。

 

3、荣获国内外认可

2023年11月受邀参加美国ACM举办的全球超级计算机大会SC23,不仅在其主展厅进行展示,还受邀在生命科学超算分会场进行了30分钟的技术展示报告。雪湖科技可重构计算集群可搭载运行YADDLE分子动力学计算专用引擎,实现百万原子10微秒每天的分子动力学模拟仿真,其分子动力学计算性能与美国ANTON2相当,为国内生命科学研究、创新药物发现等领域提供国际领先性能的国产化大规模并行计算集群技术。

 

 

雪湖科技分子动力学模拟高性能专用计算设备介绍

 

除了海报展示和芯片服务器展示外,Q-Bio 2024会议还为参会者提供了丰富的学术交流机会。会议邀请了包括斯坦福大学的James E. Ferrell教授、哈佛医学院的Sahand Hormoz教授在内的众多国际知名学者进行主题演讲。这些学术大咖将带来最前沿的科研动态和深度见解,为与会者提供宝贵的知识和启发。上海雪湖科技积极参与研讨会,与来自全球各地的学者进行深入的交流和探讨。通过面对面的沟通,分享我们的研究心得和经验,听取同行的宝贵意见和建议,共同推动定量生物学领域的发展。

 

雪湖科技亮相Q-Bio 2024国际定量生物学会议

 

在学术交流过程中,我们注重开放性和包容性,鼓励不同观点之间的碰撞和融合。我们相信,正是这种多元化的学术氛围,才能激发出更多的创新灵感和合作机会,为定量生物学领域的未来发展注入新的活力。